在启动动态分析并进行错误检查前，按下列步骤准备动态分析数据。而这些步骤不分先后顺序。
指定荷载。
如果仅须计算固有频率，则无需指定动态荷载。谐波分析需要激振频率、力或位移来定义和设置不同节点的正弦荷载。
创建谱或时程分析的动态荷载时需要特别小心。响应谱或时程曲线必须定义、创建或选择。力响应谱和时程分析须建立力组。响应谱/时程和力集须与其它数据一起建立分析的荷载工况。最后，振动结果与静态结果合成建立的其它的荷载工况结果与规范定义的偶然许用应力相比较，检查其合规性。 CAESAR II 提供了若干方法来简化这些任务。
修改模型质量和刚度
对于动态分析，CAESAR II 把每一个管道单元从两个节点之间的连续梁单元转换成两个质点间的刚度。在静态分析模型中，额外的刚度被加到节点上去模拟固定、约束、弹簧和其它支撑。分给每个节点的质量是汇入节点的所有单元质量总和的一半。这些质量仅作为平动惯性。动态质量模型中忽略转动惯性矩。将旋转惯性矩纳入分析中，只是大幅增加求解时间，而在分析精度上并无提高。
在很多情况下，静态模型建立的质量和刚度不作修改即可用于动态分析。然而，有些情况质量和刚度可以删除质点或自由度而得以改善。需要改善的模型通常是：不必要质量远离模型中感兴趣区域或不必要的自由度不是作用在感兴趣的方向上。些管道系统安装有抑制振动的支撑，但它不影响静态分析。这些不属于静态模型的振动吸能器或阻尼器可以作为附加刚度加入到动态模型中。
设置控制分析的参数
对要执行的分析类型：固有频率和模态计算、谐波分析、谱分析或时程分析，在控制参数标签页中设置其参数。分析的一般设置，诸如最大截止频率、模态求和方法、非线性约束静态荷载工况以及在动态分析中包括摩擦效应的摩擦刚度系数等也可在控制参数中定义。高级选项（Advanced）标签页允许用户更改控制提取模态本征值的参数。这些参数只在特殊情况下才作修改。